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弓形虫PRU株BSR4基因的体外扩增及生物信息学分析

郭凯 陈兴智 焦玉萌 夏惠 方强 王雪梅

引用本文:
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弓形虫PRU株BSR4基因的体外扩增及生物信息学分析

    作者简介: 郭凯(1983-),男,硕士研究生.
  • 基金项目:

    安徽省教育厅自然科学研究资助项目(2004kj287zc),安徽省教育厅优秀青年科研资助项目(2004jq174)

  • 中图分类号: R382.5

Amplification and bioinformatics analysis of Toxoplasma gondii BSR4 gene

  • CLC number: R382.5

  • 摘要: 目的: 克隆弓形虫Prugniaud(PRU)株表面抗原BSR4基因,并进行序列测定和生物信息学分析。方法: 根据BSR4基因已知序列(ME49株)设计合成一对引物,应用PCR技术从弓形虫PRU株基因组DNA中扩增BSR4基因,克隆入pET28a(+)载体并进行序列测定。用生物信息学方法对BSR4的理化性质、结构和功能进行预测。结果: 得到弓形虫PRU株BSR4基因片段,测序结果表明,获得BSR4基因片段约1 194 bp,编码398个氨基酸。同源性分析显示,弓形虫PRU株和ME49株基因序列同源性为100%,BSR4相对分子量为42 344.75,有2个功能结构域,氨基酸序列的前40位为信号肽序列。N端为信号肽,C端为疏水序列,预测它为糖基磷脂酰肌醇固着蛋白,存在18个潜在抗原表位及2个保守功能区域。结论: 成功获得弓形虫PRU株BSR4基因序列。
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出版历程
  • 收稿日期:  2010-12-13

弓形虫PRU株BSR4基因的体外扩增及生物信息学分析

    作者简介: 郭凯(1983-),男,硕士研究生.
  • 蚌埠医学院 病原生物学教研室, 感染与免疫安徽省重点实验室, 安徽 蚌埠 233030
基金项目:  安徽省教育厅自然科学研究资助项目(2004kj287zc),安徽省教育厅优秀青年科研资助项目(2004jq174)

摘要: 目的: 克隆弓形虫Prugniaud(PRU)株表面抗原BSR4基因,并进行序列测定和生物信息学分析。方法: 根据BSR4基因已知序列(ME49株)设计合成一对引物,应用PCR技术从弓形虫PRU株基因组DNA中扩增BSR4基因,克隆入pET28a(+)载体并进行序列测定。用生物信息学方法对BSR4的理化性质、结构和功能进行预测。结果: 得到弓形虫PRU株BSR4基因片段,测序结果表明,获得BSR4基因片段约1 194 bp,编码398个氨基酸。同源性分析显示,弓形虫PRU株和ME49株基因序列同源性为100%,BSR4相对分子量为42 344.75,有2个功能结构域,氨基酸序列的前40位为信号肽序列。N端为信号肽,C端为疏水序列,预测它为糖基磷脂酰肌醇固着蛋白,存在18个潜在抗原表位及2个保守功能区域。结论: 成功获得弓形虫PRU株BSR4基因序列。

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