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乳腺癌紫杉醇耐药细胞中lncRNA和mRNA表达谱筛选

陈天天 王文锐 陈素莲 陈昌杰 杨清玲

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乳腺癌紫杉醇耐药细胞中lncRNA和mRNA表达谱筛选

    作者简介: 陈天天(1992-),男,硕士研究生.
  • 基金项目:

    安徽省教育厅自然科学重大项目(KJ2015ZD29,KJ2016SD37);安徽省高校学科(专业)拔尖人才学术资助重点项目(gxbjZD27,gxbjZD2016069);安徽省学术和技术带头人后备人选科研活动经费资助项目(2017H110);蚌埠医学院研究生创新项目(Byycx1739)

  • 中图分类号: R737.9

Screening of lncRNA and mRNA expression profiles in paclitaxel-induced breast cancer MCF-7 resistant cells

  • CLC number: R737.9

  • 摘要: 目的:分析紫杉醇诱导的乳腺癌MCF-7耐药细胞(MCF-7/PR)中长链非编码RNA(lncRNA)和信使RNA(mRNA)表达谱的变化,研究筛选出调控乳腺癌紫杉醇耐药的关键lncRNAs,为逆转紫杉醇耐药的分子靶点提供理论依据。方法:利用ArraystarlncRNA芯片技术检测MCF-7/PR细胞中lncRNAs和mRNAs的表达谱;使用Agilent GeneSpring GX v12.1软件筛选差异表达的lncRNAs和mRNAs,对差异mRNAs进行GO和KEGG通路分析,得到mRNA参与的生物学途径;并同时进行lncRNAs与相应mRNAs联合分析推断lncRNAs功能。结果:通过MCF-7/PR细胞和MCF-7亲本细胞相比,共有1 504个lncRNAs和2 264个mRNAs存在差异性表达(差异倍数>2.0);通过GO聚类分析表明:上调的mRNAs和下调的mRNAs分别参与多种不同的生物过程;差异性lncRNAs可能通过影响相应mRNAs发挥其生物学功能。结论:乳腺癌紫杉醇耐药细胞中lncRNAs和mRNAs的表达存在差异,差异表达的基因可以为寻找新的化疗敏感靶点或生物标志物提供线索。
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出版历程
  • 收稿日期:  2018-09-20

乳腺癌紫杉醇耐药细胞中lncRNA和mRNA表达谱筛选

    作者简介: 陈天天(1992-),男,硕士研究生.
  • 蚌埠医学院 癌症转化医学安徽省重点实验室, 安徽 蚌埠 233030
基金项目:  安徽省教育厅自然科学重大项目(KJ2015ZD29,KJ2016SD37);安徽省高校学科(专业)拔尖人才学术资助重点项目(gxbjZD27,gxbjZD2016069);安徽省学术和技术带头人后备人选科研活动经费资助项目(2017H110);蚌埠医学院研究生创新项目(Byycx1739)

摘要: 目的:分析紫杉醇诱导的乳腺癌MCF-7耐药细胞(MCF-7/PR)中长链非编码RNA(lncRNA)和信使RNA(mRNA)表达谱的变化,研究筛选出调控乳腺癌紫杉醇耐药的关键lncRNAs,为逆转紫杉醇耐药的分子靶点提供理论依据。方法:利用ArraystarlncRNA芯片技术检测MCF-7/PR细胞中lncRNAs和mRNAs的表达谱;使用Agilent GeneSpring GX v12.1软件筛选差异表达的lncRNAs和mRNAs,对差异mRNAs进行GO和KEGG通路分析,得到mRNA参与的生物学途径;并同时进行lncRNAs与相应mRNAs联合分析推断lncRNAs功能。结果:通过MCF-7/PR细胞和MCF-7亲本细胞相比,共有1 504个lncRNAs和2 264个mRNAs存在差异性表达(差异倍数>2.0);通过GO聚类分析表明:上调的mRNAs和下调的mRNAs分别参与多种不同的生物过程;差异性lncRNAs可能通过影响相应mRNAs发挥其生物学功能。结论:乳腺癌紫杉醇耐药细胞中lncRNAs和mRNAs的表达存在差异,差异表达的基因可以为寻找新的化疗敏感靶点或生物标志物提供线索。

English Abstract

参考文献 (16)

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