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结核病是全球范围内普遍关注的疾病和健康问题,据最新的世界防治结核病日统计数据显示,结核病已成为最致命的传染疾病,全世界范围内每年新增结核病病人约800万,自2016年以来因该病死亡病人约170万[1-2]。近年来,受传播途径未得到有效遏制、结核菌抗体产生等原因导致发病率有回升态势,准确、快速诊断结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)感染,明确其耐药情况对病人病情控制意义重大。Xpert MTB/RIF法和基因芯片法是近年来出现的以核酸为靶标的分子生物学诊断方法,两种方法均具有检测时间短的优点,但存在费用较高及假阳性等不足。LEE等[3-4]国内外学者均证实这两种方法在鉴别MTB及其耐药性中具有很高的特异度和敏感度。但分子生物学检测与改良罗氏培养法、比例法等检测方法在MTB鉴别、耐药性分析中是否存在明显优势目前尚无明确定论,本文对几种检测方法的优劣性进行比较。
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Xpert MTB/RIF法检测周期最短(1.6~2 h),基因芯片法次之(6~8 h),改良罗氏培养法和比例法检测周期相近(分别为35~40 d和32~45 d)。
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4种菌在3×102 cfu/mL或以上浓度菌悬液在中性罗氏菌培养基、TCH均有菌落生长,但中性罗氏培养基菌落数量明显多于TCH,说明罗氏培养基最低检出限为3×102 cfu/mL。中性罗氏培养基菌落数量与稀释浓度的增加呈增多趋势(见表 1),其与培养时间的关系见图 1。
浓度/
(cfu/mL)标准H37Rν 敏感 耐链霉素 MDR 中性 PNB TCH 中性 PNB TCH 中性 PNB TCH 中性 PNB TCH 0 - - - - - - - - - - - - 3×100 - - - - - - - - - - - - 3×102 45 - + 42 - + 40 - + 41 - + 3×104 34 - + 32 - + 36 - + 35 - + 3×106 30 - + 28 - + 31 - + 30 - + 3×108 23 - + 25 - + 25 - + 22 - + 表 1 改良罗氏培养检测MTB菌落数(cfu)
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3×104 cfu/mL浓度以下未检测出MTB,≥3×104 cfu/mL菌浓度基因芯片均检出MTB,并且可检出异烟肼(INH)、利福平(RFP)的耐药性(见表 2)。
浓度/
(cfu/mL)H37Rν 敏感 耐链霉素 MDR MTB RFP INH MTB RFP INH MTB RFP INH MTB RFP INH 0 — — — — — — — — — — — — 3×100 — — — — — — — — — — — — 3×102 — — — — — — — — — — — — 3×104 Y N N Y N N Y N N Y y y 3×106 Y N N Y N N Y N N Y y y 3×108 Y N N Y N N Y N N Y y y Y示可鉴别出MTB;y示耐INH和RFP;N示不耐INH、RFP 表 2 基因芯片法对MTB及其耐药性检测结果
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该方法能依据Ct值确定样本带菌数量,在3×102、3×104、3×106、3×108 cfu/mL浓度菌含量的检测结果依次为“极低”“低”“中”“中”。该结果与相应浓度菌悬液含菌数量完全一致。在3×102 cfu浓度时Xpert MTB/RIF法检测RFP耐药性时有假阳性现象(见表 3)。
浓度/(cfu/mL) H37Rν 敏感 耐链霉素 MDR MTB RFP MTB RFP MTB RFP MTB RFP 0 — — — — — — — — 3×100 — — — — — — — — 3×102 极低 不明确 极低 N 极低 Y 极低 Y 3×104 低 N 低 N 低 N 低 Y 3×106 中 N 中 N 中 N 中 Y 3×108 中 N 中 N 中 N 中 Y N示不耐RFP;Y示有耐药性 表 3 Xpert MTB/RIF法鉴别MTB和RFP耐药性结果
分子生物学方法在结核分枝杆菌及其耐药性检测中的价值
Value of molecular biology method in detection of Mycobacterium tuberculosis and its drug resistance
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摘要:
目的探讨分子生物学方法在结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)及其耐药性检测中的价值。 方法以MTB标准菌株H37Rν作为对照,以单耐药及耐多药的MTB行梯度浓度稀释后作为检测样本,分析Xpert MTB/RIF法、基因芯片法、改良罗氏培养法、比例法检测MTB的准确性、最低检出限及检测周期等。 结果改良罗氏培养法和Xpert MTB/RIF法检测MTB下限均为3×102 cfu/mL,基因芯片法检出下限为3×104 cfu/mL;Xpert MTB/RIF法在3×102 cfu/mL时检测利福平耐药性存在假阳性现象,无法检测异烟肼的耐药性;Xpert MTB/RIF法检测周期≤2 h,而基因芯片法≤8 h,比例法和改良罗氏培养法检测周期在5~8周。 结论在MTB及其耐药性检测中分子生物学方法的检测周期优势明显,在最低检出限和准确性方面各有优势,因此,临床诊断中综合考虑病人的经济水平和病情危重程度,选择合适的检测方法。 -
关键词:
- 结核分枝杆菌 /
- Xpert MTB/RIF法 /
- 基因芯片法 /
- 耐药性
Abstract:ObjectiveTo explore the value of molecular biology method in the detection of Mycobacterium tuberculosis (MTB) and its drug resistance. MethodsThe accuracy, minimum detection limit and detection period of Xpert MTB/RIF assay, gene chip assay, modified Roche culture assay and proportion assay in detecting MTB were analyzed using standard MTB strain H37Rr as control, and single-drug resistant and multi-drug resistant MTB diluted gradiently as the test sample. ResultsThe minimum detection limit of modified Roche culture assay and Xpert MTB/RIF assay was 3×102 cfu/mL, which was 3×104 cfu/mL for gene chip assay.Xpert MTB/RIF assay resulted in false-positive rifampicin resistance when the concentration was 3×102 cfu/mL, and could not detect isoniazid resistance.The detection period of Xpert MTB/RIF assay was ≤ 2 h, which was ≤ 8 h for gene chip assay, and five to eight weeks for modified Roche culture assay and proportion assay. ConclusionsIn the detection of MTB and its drug resistance, molecular biology methods have obvious advantages in detection period, and each method has its own advantages in the minimum detection limit and accuracy.The economic level and critical degree of patients should be considered in the clinical diagnosis, so to choose appropriate detecting method. -
Key words:
- Mycobacterium tuberculosis /
- Xpert MTB/RIF assay /
- gene chip assay /
- drug resistance
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表 1 改良罗氏培养检测MTB菌落数(cfu)
浓度/
(cfu/mL)标准H37Rν 敏感 耐链霉素 MDR 中性 PNB TCH 中性 PNB TCH 中性 PNB TCH 中性 PNB TCH 0 - - - - - - - - - - - - 3×100 - - - - - - - - - - - - 3×102 45 - + 42 - + 40 - + 41 - + 3×104 34 - + 32 - + 36 - + 35 - + 3×106 30 - + 28 - + 31 - + 30 - + 3×108 23 - + 25 - + 25 - + 22 - + 表 2 基因芯片法对MTB及其耐药性检测结果
浓度/
(cfu/mL)H37Rν 敏感 耐链霉素 MDR MTB RFP INH MTB RFP INH MTB RFP INH MTB RFP INH 0 — — — — — — — — — — — — 3×100 — — — — — — — — — — — — 3×102 — — — — — — — — — — — — 3×104 Y N N Y N N Y N N Y y y 3×106 Y N N Y N N Y N N Y y y 3×108 Y N N Y N N Y N N Y y y Y示可鉴别出MTB;y示耐INH和RFP;N示不耐INH、RFP 表 3 Xpert MTB/RIF法鉴别MTB和RFP耐药性结果
浓度/(cfu/mL) H37Rν 敏感 耐链霉素 MDR MTB RFP MTB RFP MTB RFP MTB RFP 0 — — — — — — — — 3×100 — — — — — — — — 3×102 极低 不明确 极低 N 极低 Y 极低 Y 3×104 低 N 低 N 低 N 低 Y 3×106 中 N 中 N 中 N 中 Y 3×108 中 N 中 N 中 N 中 Y N示不耐RFP;Y示有耐药性 -
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