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安徽省蚌埠市麻疹野毒株核蛋白基因检测及序列分析

王伟 王海梅 郑晶 郑照军 刘双成 钟政荣

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安徽省蚌埠市麻疹野毒株核蛋白基因检测及序列分析

    作者简介: 王伟(1976- ),男,硕士,讲师,主管检验师.
  • 基金项目:

    蚌埠医学院科研课题资助项目(BY1036)

Nucleoprotein gene detection and sequence analysis of wild-type measles strains from patients in Bengbu,Anhui

  • 摘要: 目的:通过检测麻疹野毒株的基因型,分析安徽省蚌埠市麻疹病毒流行株的基因特征,为麻疹监测和防治提供依据。方法:选取2010~2011年蚌埠市散发的15例临床确诊为麻疹的患者,收集患者急性传染期的尿液标本,提取病毒RNA,用RT-PCR方法扩增麻疹病毒核蛋白基因羧基末端的515 bp核苷酸片段,对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析,构建基因亲缘关系树。结果:15份麻疹患者尿液标本中有14份分离到麻疹野毒株;将其中3株麻疹野毒株的核蛋白(N)羧基末端515 bp核苷酸与Genebank中麻疹病毒的8个参考株进行基因同源性关系比较,与Genebank中公布的H1、H2基因型参考株Hunan.CHN93-7、Beijing.CHN94-1所对应的核苷酸序列的遗传距离分别为0.020~0.026和0.064~0.075;而与H1a参考株China93-2的遗传距离最近,为0.009~0.015;3株麻疹野毒株N羧基末端515个核苷酸的同源性为97.8%~98.9%;与H1参考株Hunan.CHN93-7、H1a参考株China 93-2和H1b参考株China 94-7的核苷酸同源性分别为97.4%~98.0%、98.5%~99.1%和96.5%~97.1%。结论:蚌埠市麻疹野毒株的优势基因型为H1a基因亚型。
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出版历程
  • 收稿日期:  2012-09-06
  • 刊出日期:  2013-05-15

安徽省蚌埠市麻疹野毒株核蛋白基因检测及序列分析

    作者简介: 王伟(1976- ),男,硕士,讲师,主管检验师.
  • 1. 蚌埠医学院第一附属医院 检验科, 安徽 蚌埠 233004
基金项目:  蚌埠医学院科研课题资助项目(BY1036)

摘要: 目的:通过检测麻疹野毒株的基因型,分析安徽省蚌埠市麻疹病毒流行株的基因特征,为麻疹监测和防治提供依据。方法:选取2010~2011年蚌埠市散发的15例临床确诊为麻疹的患者,收集患者急性传染期的尿液标本,提取病毒RNA,用RT-PCR方法扩增麻疹病毒核蛋白基因羧基末端的515 bp核苷酸片段,对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析,构建基因亲缘关系树。结果:15份麻疹患者尿液标本中有14份分离到麻疹野毒株;将其中3株麻疹野毒株的核蛋白(N)羧基末端515 bp核苷酸与Genebank中麻疹病毒的8个参考株进行基因同源性关系比较,与Genebank中公布的H1、H2基因型参考株Hunan.CHN93-7、Beijing.CHN94-1所对应的核苷酸序列的遗传距离分别为0.020~0.026和0.064~0.075;而与H1a参考株China93-2的遗传距离最近,为0.009~0.015;3株麻疹野毒株N羧基末端515个核苷酸的同源性为97.8%~98.9%;与H1参考株Hunan.CHN93-7、H1a参考株China 93-2和H1b参考株China 94-7的核苷酸同源性分别为97.4%~98.0%、98.5%~99.1%和96.5%~97.1%。结论:蚌埠市麻疹野毒株的优势基因型为H1a基因亚型。

English Abstract

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